Refere-se à estrutura conceitual e ao conjunto de funções, suas subfunções e interfaces (internas e externas) que definem as transformações dos fluxos de entrada em fluxos de saída, executados pelo sistema para cumprir sua missão. Enfatiza a sequência de execução, as condições para controle ou fluxo de dados e os requisitos de desempenho para satisfazer os requisitos especificados para um sistema. Está associada à arquitetura comportamental, que enfatiza mais o sequenciamento de suas execuções do que as transformações realizadas (alvo da arquitetura funcional). Em geral os aspectos funcionais e comportamentais encontram-se entrelaçados em um sistema. [SEBOK, 2020]